01
Identificación de secuencias
Compara secuencias biológicas con bases de datos moleculares de referencia y examina las coincidencias más relevantes.
Identificación molecular
mentaxonomy_mo-bio
Identifica secuencias biológicas utilizando bases de datos moleculares de referencia.
De la comparación de secuencias a una identificación molecular trazable.
Secuencia biológica
mentaxonomy_mo-bio
Identificación molecular
Identificación + MTAX
El problema
Un resultado molecular es mucho más que un nombre.
La identificación molecular compara secuencias biológicas con datos de referencia para determinar qué organismos presentan las coincidencias más próximas.
El resultado no depende únicamente de la propia secuencia, sino también de la base de datos de referencia, el método de análisis y el estado de esos recursos en el momento en que se realiza la identificación.
mentaxonomy_mo-bio reúne estos elementos, permitiendo identificar secuencias y conservar el análisis molecular resultante como un registro trazable.
Características
Identificación molecular con contexto.
mentaxonomy_mo-bio combina análisis de secuencias, datos de referencia y registros estructurados de los análisis dentro del ecosistema mentaxonomy.
02
Múltiples fuentes de referencia
Utiliza recursos moleculares especializados según el grupo de organismos y la secuencia que se esté analizando.
03
Resultados comparables
Examina las coincidencias entre secuencias utilizando las métricas de alineamiento e identificación relevantes obtenidas durante el análisis.
04
Registros de análisis MTAX
Conserva el análisis molecular en un registro MTAX estructurado en lugar de reducir el resultado a un nombre científico.
05
Identificación trazable
Mantén la secuencia, la fuente de referencia y el contexto del análisis asociados a la identificación resultante.
06
Análisis independiente
Utiliza mentaxonomy_mo-bio directamente o integra sus resultados moleculares en flujos de trabajo más amplios de colecciones biológicas.
Datos moleculares de referencia
Diferentes bases de datos para diferentes preguntas biológicas.
mentaxonomy_mo-bio proporciona acceso a recursos moleculares de referencia seleccionados según la secuencia y el grupo de organismos que se estén analizando.
Búsqueda general de secuencias
NCBI
Comparación remota de secuencias con recursos de NCBI para identificación molecular general y búsquedas de referencia.
Hongos
UNITE
Datos de referencia especializados en hongos para identificación molecular mediante recursos de secuencias curados.
ARN ribosómico
SILVA
Secuencias de referencia de ARN ribosómico para comparación e identificación molecular de grupos microbianos.
Registro del análisis
La identificación no termina con el resultado.
MTAX conserva el análisis molecular como un registro estructurado, manteniendo el resultado junto con la información necesaria para comprender cómo se obtuvo esa identificación.
MTAX
Conserva la historia de la identificación molecular.
Una secuencia puede analizarse más de una vez a medida que evolucionan las bases de datos de referencia, el conocimiento taxonómico y los recursos analíticos.
MTAX proporciona un formato estructurado para conservar cada análisis molecular en lugar de sobrescribir los resultados de identificaciones anteriores.
Esto permite conservar el contexto de una identificación y, cuando se integra con menta®, preservar la evolución de las identificaciones moleculares asociadas a un aislado biológico.
Cómo funciona
De la secuencia a la identificación molecular.
mentaxonomy_mo-bio combina la comparación de secuencias con la información necesaria para conservar y revisar el análisis resultante.
-
1
Introduce la secuencia
Introduce la secuencia biológica que deseas analizar y selecciona el recurso molecular de referencia adecuado.
-
2
Compara con los datos de referencia
mentaxonomy_mo-bio busca en la fuente de referencia seleccionada y devuelve las coincidencias de secuencia más relevantes y las métricas del análisis.
-
3
Revisa y conserva el análisis
Examina la evidencia molecular y conserva el análisis resultante como un registro MTAX para su futura consulta y comparación.
Tres componentes complementarios
Datos taxonómicos, resolución de nombres e identificación molecular.
Cada componente de mentaxonomy aborda una parte diferente del flujo de trabajo de identificación e información taxonómica.
Datos locales
mentaxonomy_db
Conjuntos de datos taxonómicos completos desplegados localmente para búsquedas rápidas, autocompletado y enriquecimiento de datos científicos.
Explorar mentaxonomy_dbResolución de nombres
mentaxonomy_api
Una API independiente del proveedor para resolver el nombre científico aceptado actualmente mediante autoridades taxonómicas externas.
Explorar mentaxonomy_apiIdentificación molecular
mentaxonomy_mo-bio
Identificación molecular de secuencias mediante bases de datos de referencia, con registros MTAX estructurados para conservar el análisis.
Explorar mentaxonomy_mo-bioExplora mo-bio
De la secuencia a una identificación trazable.
Descubre mentaxonomy_mo-bio, conoce cómo trabajan conjuntamente la identificación molecular y MTAX y accede a las herramientas Identify y Viewer.